Step3: Make a heatmap of a human body

Output of the sample program

Reference： Kokumin-eisei no Doko (Journal of health and welfare statistics), Tokyo, 2006 (in Japanese)

 

Mortality data in 2006 (enclosed by the red rectangle) are displayed on BodyParts3D.
Skin and breast are excluded.
Numerical values (mortality) are converted into blue, green, yellow and red in ascending order.

Explanation of the sample code

See also Javadoc for details of each methods.

line 17： Display a color bar.

line 39-107：　Set a numerical value to the organ with setScalar() method

Related properties of AgOrgan

Property	Description	Default value	Setter example
Numerical value to map	Real number (Double)	0.0	setScalar(100)

Related properties of AgProp

Property	Description	Default value	Setter example
Range of numerical values	Outliers are rounded to the border value (i.e. min or max value) to prevent the map from being the same color.	null	setScalarRange(0,100)

Sample code

1 import jp.dbcls.ag.AgClient;
2 import jp.dbcls.ag.AgOrgan;
3 import jp.dbcls.ag.AgProp;
4 
5 import java.util.ArrayList;
6 
7 /**
8  * Step3 数値を色情報に変換して臓器にマップし、がんの部位別死亡数マップを作成する。
9  */
10 public class Step3 {
11   static AgProp prop = null;
12 
13   static ArrayList organs = null;
14 
15   public static void main(String[] args) throws Exception {
16     prop = new AgProp();
17     prop.setWinSize(240, 640);
18     /** カラーバーを表示します。 * */
19     prop.setColorBarOn(1);
20 
21     organs = new ArrayList();
22     AgOrgan o;
23 
24     /** 体幹と全身の骨と皮膚を背景として描画する * */
25     o = new AgOrgan();
26     o.setName("trunk"); // 体幹
27     organs.add(o);
28 
29     o = new AgOrgan();
30     o.setName("skin"); // 皮膚
31     o.setOpacity(0.2);
32     organs.add(o);
33 
34     o = new AgOrgan();
35     o.setName("bone"); // 骨
36     organs.add(o);
37 
38     /** がんの部位別死亡数をsetScalar()でセットする * */
39     o = new AgOrgan();
40     o.setName("throat"); // 咽頭
41     o.setScalar(4034);
42     organs.add(o);
43 
44     o = new AgOrgan();
45     o.setName("esophagus"); // 食道
46     o.setScalar(9405);
47     organs.add(o);
48 
49     o = new AgOrgan();
50     o.setName("stomach"); // 胃
51     o.setScalar(32851);
52     organs.add(o);
53 
54     o = new AgOrgan();
55     o.setName("colon"); // 結腸
56     o.setScalar(13305);
57     organs.add(o);
58 
59     o = new AgOrgan();
60     o.setName("rectum"); // 直腸
61     o.setScalar(8530);
62     organs.add(o);
63 
64     o = new AgOrgan();
65     o.setName("liver"); // 肝臓
66     o.setScalar(23421);
67     organs.add(o);
68 
69     o = new AgOrgan();
70     o.setName("gallbladder"); // 胆嚢
71     o.setScalar(7476);
72     organs.add(o);
73 
74     o = new AgOrgan();
75     o.setName("pancreas"); // 膵
76     o.setScalar(11933);
77     organs.add(o);
78 
79     o = new AgOrgan();
80     o.setName("larynx"); // 喉頭
81     o.setScalar(964);
82     organs.add(o);
83 
84     o = new AgOrgan();
85     o.setName("lung"); // 肺
86     o.setScalar(43921);
87     organs.add(o);
88 
89     o = new AgOrgan();
90     o.setName("trachea"); // 気管
91     o.setScalar(43921);
92     organs.add(o);
93 
94     o = new AgOrgan();
95     o.setName("prostate"); // 前立腺
96     o.setScalar(8840);
97     organs.add(o);
98 
99     o = new AgOrgan();
100     o.setName("bladder"); // 膀胱
101     o.setScalar(3817);
102     organs.add(o);
103 
104     o = new AgOrgan();
105     o.setName("nerve"); // 神経
106     o.setScalar(926);
107     organs.add(o);
108 
109     String imageurl = AgClient.getImage(prop, organs);
110 
111     String imagefile = "step3.png";
112     AgClient.saveFile(imageurl, imagefile);
113   }
114 }