遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-05-25English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(18,438)
  霊長
(205)
  齧歯
(12,530)
  哺乳
(774)
  脊椎
(1,152)
  無脊椎
(3,917)
  植物
(6,619)
  バクテリア
(2,962)
  ウィルス
(50)
  ファージ
(4)
  未分類
(282)
  すべて
(46,983)
 
  SAGE NlaIII
(0)
  SAGE RsaI
(0)
  SAGE Sau3A
(0)
  MPSS
(0)
  GeneChip
(641)
  タイリングアレイ
(82)
  cDNAアレイ
(677)
  オリゴアレイ
(1,428)
  ビーズアレイ
(0)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(0)
  RT-PCR
(5)
  HT-Seq
(118)
  その他
(11)
  すべて
(2,962)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 [E-MTAB-706] Quantitative RNA-seq analysis of the transcriptome of Campylobacter jejuni (GSE30621) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer (Campylobacter jejuni) (GPL13903) European Bioinformatics Institute 2011-07-12 カンピロバクター感染症原因菌(Campylobacter jejuni)
Campylobacter jejuni
4
(0×4)
4 by_platform
by_series
2 [E-MTAB-502] Citrobacter rodentium transcriptomics (Regulation) (GSE30610) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Citrobacter rodentium) (GPL13894) European Bioinformatics Institute 2011-07-12 病原性大腸菌(Citrobacter rodentium)
Citrobacter rodentium
2
(0×2)
2 by_platform
by_series
3 [E-MTAB-387] RNA sequencing in E. coli K12 (GSE24998) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Escherichia coli) (GPL10328) European Bioinformatics Institute 2010-10-28 大腸菌(Escherichia coli)
Escherichia coli
2
(0×2)
2 by_platform
by_series
4 [E-MTAB-332] H-NS and Fis binding to E. coli K12 (GSE24991) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Escherichia coli) (GPL10328) European Bioinformatics Institute 2010-10-28 大腸菌(Escherichia coli)
Escherichia coli
9
(0×9)
9 by_platform
by_series
5 Zymomonas mobilis oxygen stress responses (GSE10302) [オリゴアレイ] ZMOBCombimatrixplatform (GPL6431) Science Apps, L3C 2008-01-28 Zymomonas mobilis
Zymomonas mobilis
53,304
(2,221×24)
24 by_platform
by_series
6 Zur regulon of Neisseria meningitidis (GSE38033) [オリゴアレイ] Wuerzburg Neisseria meningitidis 15.4K (GPL8787) University of Wuerzburg 2012-05-17 髄膜炎菌(Neisseria meningitidis)
Neisseria meningitidis
168,960
(15,360×11)
11 by_platform
by_series
7 Yersinia pseudotuberculosis ymoA mutant vs. wild type YPIII (GSE35043) [オリゴアレイ] Agilent-020412 Yersinia pseudotuberculosis YPIII gene expression array (GPL15095) Helmholtz Centre for Infection Research 2012-01-12 Yersinia pseudotuberculosis YPIII
Yersinia pseudotuberculosis YPIII
62,976
(15,744×4)
4 by_platform
by_series
8 Y. pestis KIM6+ TraSH Microarray Analysis After Intracellular Replication (GSE33982) [オリゴアレイ] JCVI PFGRC Yersinia pestis 30K v2 array designed primarily based on strain KIM (GPL4199) Stony Brook University 2011-11-28 ペスト菌(Yersinia pestis)
Yersinia pestis
21,316
(5,329×4)
4 by_platform
by_series
9 Xylella fastidiosa Study on different growth media (GSE13748) [cDNAアレイ] UNESP Xylella fastidiosa array version 1 (GPL7554) Max-Delbruck Center for Molecular Medicine 2008-11-26 ブドウピアス病菌(Xylella fastidiosa)
Xylella fastidiosa
1,479
(493×3)
3 by_platform
by_series
10 Xylella fastidiosa 9a5c: gomesin-treated cells vs. control (GSE17605) [cDNAアレイ] IQ-USP Xylella fastidiosa 9.2K v2.0. (GPL9024) Universidade de São Paulo 2009-08-12 ブドウピアス病菌(Xylella fastidiosa)
Xylella fastidiosa
92,160
(4,608×20)
20 by_platform
by_series
11 Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Indian Isolate): Wild type vs. rpfF mutant (GSE27809) [オリゴアレイ] Agilent-025096 Genotypic Technology designed Custom Xanthomonas oryzae 8x15k Gene Expression Profiling Microarray (GPL13231) Genotypic Technology 2011-03-07 Xanthomonas oryzae pv. oryzae
Xanthomonas oryzae pv. oryzae
32,452
(8,113×4)
4 by_platform
by_series
12 Xanthomonas campestris pv. campestris 8004: wild type vs. ravA (or ravS or ravR) mutant (GSE32908) [cDNAアレイ] CapitalBio 4.3K Xcc cDNA array (GPL14720) institute of microbiology, Chinese academy of sciences 2011-10-12 Xanthomonas campestris pv. campestris
Xanthomonas campestris pv. campestris
84,672
(14,112×6)
6 by_platform
by_series
13 Wt-ko_trxB1_Filtered bkg correc transf-norm (GSE8672) [オリゴアレイ] WCFS Lactobacillus plantarum 11K 60-mer array, Version 1, our ID LPAG1 (GPL4318) TI Food and Nutrition 2007-08-03 乳酸菌(Lactobacillus plantarum)
Lactobacillus plantarum
64,842
(10,807×6)
6 by_platform
by_series
14 WT vs WTmitomycinC comparison (GSE35518) [オリゴアレイ] UCL Streptococcus thermophilus 15K 60-mer array, Version 1, our ID Agilent-023342 LMD-9v2 (GPL13365) Université catholique de louvain 2012-02-02 乳酸菌(Streptococcus thermophilus)
Streptococcus thermophilus
47,232
(15,744×3)
3 by_platform
by_series
15 WT vs KO of lp_2991 comparison (GSE20515) [オリゴアレイ] WCFS Lactobacillus plantarum 11K 60-mer array, Version 2 (GPL9359) NIZO food research 2010-02-24 Lactobacillus plantarum WCFS1
Lactobacillus plantarum WCFS1
21,614
(10,807×2)
2 by_platform
by_series
16 WT vs KO mecA comparison (GSE28371) [オリゴアレイ] UCL Streptococcus thermophilus 15K 60-mer array, Version 1, our ID Agilent-023342 LMD-9v2 (GPL13365) Université catholique de louvain 2011-04-04 乳酸菌(Streptococcus thermophilus)
Streptococcus thermophilus
47,232
(15,744×3)
3 by_platform
by_series
17 WT vs KO hdiR comparison (GSE35517) [オリゴアレイ] UCL Streptococcus thermophilus 15K 60-mer array, Version 1, our ID Agilent-023342 LMD-9v2 (GPL13365) Université catholique de louvain 2012-02-02 乳酸菌(Streptococcus thermophilus)
Streptococcus thermophilus
47,232
(15,744×3)
3 by_platform
by_series
18 WT vs KO comX comparison (GSE28372) [オリゴアレイ] UCL Streptococcus thermophilus 15K 60-mer array, Version 1, our ID Agilent-023342 LMD-9v2 (GPL13365) Université catholique de louvain 2011-04-04 乳酸菌(Streptococcus thermophilus)
Streptococcus thermophilus
47,232
(15,744×3)
3 by_platform
by_series
19 WT 14028 versus mutant (GSE2455) [cDNAアレイ] STv5B_MMCC (GPL1835) Institute of Cellular and Molecular Biology 2005-03-29 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
69,312
(5,776×12)
12 by_platform
by_series
20 WT (Fis+) strain (GSE7380) [GeneChip] [Ecoli_ASv2] Affymetrix E. coli Antisense Genome Array (GPL199) University at Albany 2007-03-27 大腸菌(Escherichia coli)
Escherichia coli
87,744
(7,312×12)
12 by_platform
by_series
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