遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-04-06English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(502,421)
  霊長
(4,928)
  齧歯
(181,106)
  哺乳
(16,260)
  脊椎
(18,263)
  無脊椎
(37,338)
  植物
(91,454)
  バクテリア
(39,082)
  ウィルス
(1,266)
  ファージ
(101)
  未分類
(5,242)
  すべて
(898,944)
 
  SAGE NlaIII
(0)
  SAGE RsaI
(0)
  SAGE Sau3A
(0)
  MPSS
(0)
  GeneChip
(7,355)
  タイリングアレイ
(676)
  cDNAアレイ
(10,532)
  オリゴアレイ
(19,682)
  ビーズアレイ
(0)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(0)
  RT-PCR
(51)
  HT-Seq
(729)
  その他
(57)
  すべて
(39,082)
 
 
(118)
 
(706)
  結合
(170)
  生殖
(108)
 
(90)
  消化
(772)
 
(78)
 
(251)
 
(19)
  分泌
(204)
  胎児
(25)
  地上構造
(0)
  若い地上構造
(0)
 
(0)
  成長点
(0)
  花・生殖
(0)
  種子・果実
(0)
  混合
(217)
  分類不能
(36,324)
  すべて
(39,082)
 
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サンプルID タイトル データ数 登録機関 登録日 プラットフォーム サンプルタイプ 生物種 臓器分類 分類の根拠
黒字の強調部分が臓器分類時に用いたキーワードになります。
1 GSM1099266 LB 2,023,636 University of California 2013-03-15 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling v2 [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL16797) RNA Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:MR-1 grown in rich LB medium title:LB description:cDNA
2 GSM1099267 DMSO 2,023,636 University of California 2013-03-15 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling v2 [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL16797) RNA Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:MR-1 grown in minimal lactate medium anaerobically with dimethyl sulfoxide as the electron acceptor title:DMSO description:cDNA
3 GSM1099268 FE 2,023,636 University of California 2013-03-15 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling v2 [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL16797) RNA Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:MR-1 grown in minimal lactate medium anaerobically with iron (III) citrate as the electron acceptor title:FE description:cDNA
4 GSM1099269 HS 2,023,636 University of California 2013-03-15 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling v2 [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL16797) RNA Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:MR-1 heat shocked for 10 minutes at 42 oC. title:HS description:cDNA
5 GSM1099270 Genomic 2,023,636 University of California 2013-03-15 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling v2 [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL16797) genomic Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:MR-1 grown in rich LB medium title:Genomic
6 GSM731851 rich media DvH LS 2,003,627 Lawrence Berkeley Lab 2011-05-26 [オリゴアレイ] NimbleGen Desulfovibrio vulgaris Hildenborough 2004K (GPL13654) RNA Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough
Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough
分類不能 source_name:DvH grown in lactate/sulfate media supplemented with yeast extract (LS) title:rich media DvH LS description:Mid-log phase DvH in LS, 2 biological replicates
7 GSM731852 minimal media DvH LS4D 2,003,627 Lawrence Berkeley Lab 2011-05-26 [オリゴアレイ] NimbleGen Desulfovibrio vulgaris Hildenborough 2004K (GPL13654) RNA Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough
Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough
分類不能 source_name:DvH grown in minimal media title:minimal media DvH LS4D description:Mid-log phase DvH in LS4D, 1 biological replicate
8 GSM969798 MM 1,937,190 Lawrence Berkeley Lab 2012-07-18 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL15823) RNA Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:Mid-log-phase MR-1 in minimal lactate medium title:MM description:mRNA hyb
9 GSM969799 genomic control 1,937,190 Lawrence Berkeley Lab 2012-07-18 [タイリングアレイ] Custom NimbleGen Shewanella oneidensis MR-1 Tiling [NimbleGen_MR1_2005K_1] (GPL15823) genomic Shewanella oneidensis MR-1
Shewanella oneidensis MR-1
分類不能 source_name:Mid-log-phase MR-1 in minimal lactate medium title:genomic control description:genomic DNA hyb
10 GSM724228 continuous light T = 60 hours 458,333 Harvard University 2011-05-15 [オリゴアレイ] Agilent Array ID 022715 (forward strand) and Array ID 022716 (reverse strand) (GPL13535) RNA Synechococcus elongatus PCC 7942
Synechococcus elongatus PCC 7942
分類不能 source_name:continuous light T = 60 hours average of T = 24 through 80 in 4 hour intervals title:continuous light T = 60 hours
11 GSM724229 continuous light T = 68 hours 458,333 Harvard University 2011-05-15 [オリゴアレイ] Agilent Array ID 022715 (forward strand) and Array ID 022716 (reverse strand) (GPL13535) RNA Synechococcus elongatus PCC 7942
Synechococcus elongatus PCC 7942
分類不能 source_name:continuous light T = 68 hours average of T = 24 through 80 in 4 hour intervals title:continuous light T = 68 hours
12 GSM724230 continuous light T = 72 hours 458,333 Harvard University 2011-05-15 [オリゴアレイ] Agilent Array ID 022715 (forward strand) and Array ID 022716 (reverse strand) (GPL13535) RNA Synechococcus elongatus PCC 7942
Synechococcus elongatus PCC 7942
分類不能 source_name:continuous light T = 72 hours average of T = 24 through 80 in 4 hour intervals title:continuous light T = 72 hours
13 GSM724231 continuous light T = 80 hours 458,333 Harvard University 2011-05-15 [オリゴアレイ] Agilent Array ID 022715 (forward strand) and Array ID 022716 (reverse strand) (GPL13535) RNA Synechococcus elongatus PCC 7942
Synechococcus elongatus PCC 7942
分類不能 source_name:continuous light T = 80 hours average of T = 24 through 80 in 4 hour intervals title:continuous light T = 80 hours
14 GSM635865 BAPHK_cDNA1 transcriptome profile 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-07 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) RNA 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
15 GSM635866 BAPHK_cDNA2 transcriptome profile 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-07 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) RNA 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
16 GSM635883 BAPHK_cDNA3 transcriptome profile 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-07 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) RNA 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
17 GSM635902 BAPHK_R15 transcriptome profile 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-07 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) RNA 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
18 GSM635903 BAPHK_R16 transcriptome profile 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-07 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) RNA 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
19 GSM636914 cDNA_DNAref1 Genomic DNA 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-08 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) genomic 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
20 GSM636915 cDNA_DNAref2 Genomic DNA 409,807 The Forsyth Institute 2010-12-08 [タイリングアレイ] Porphyromonas gingivalis W83 genomic tiling array mapped format (GPL11291) genomic 歯周病原性菌(Porphyromonas gingivalis)
Porphyromonas gingivalis
末梢血 Laboratory culture on BAPHK blood plate
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