遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2014-04-12English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(22,139)
  霊長
(288)
  齧歯
(15,364)
  哺乳
(970)
  脊椎
(1,364)
  無脊椎
(4,819)
  植物
(7,611)
  バクテリア
(3,409)
  ウィルス
(59)
  ファージ
(8)
  未分類
(433)
  すべて
(56,529)
 
  SAGE NlaIII
(13)
  SAGE RsaI
(0)
  SAGE Sau3A
(1)
  MPSS
(0)
  GeneChip
(333)
  タイリングアレイ
(20)
  cDNAアレイ
(154)
  オリゴアレイ
(314)
  ビーズアレイ
(12)
  タンパク質アレイ
(1)
  抗体アレイ
(0)
  RT-PCR
(5)
  HT-Seq
(113)
  その他
(4)
  すべて
(970)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Copy number variation in the porcine genome (GSE19047) [オリゴアレイ] NimbleGen agrsci porcine 2.1M v1 (GPL9664) Aarhus University, Faculty of Agricultural Sciences 2009-11-16 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
102,881,808
(2,143,371×48)
48 by_platform
by_series
2 CGH analyses for the Chinese indigenous pig breeds and commercial pig breeds (GSE46847) [オリゴアレイ] NimbleGen Sus scrofa 2.1M CGH array [120529_Sscr_10_2_WG_JH_CGH_HX1] (GPL17150) China Agriculture University 2013-05-11 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
26,013,228
(2,167,769×12)
12 by_platform
by_series
3 Assessment of genome integrity with array CGH of cattle transgenic cell lines produced by homologous recombination and somatic cell cloning (GSE26132) [オリゴアレイ] NimbleGen Bos taurus UMD3.0 2.1M WG HD CGH (GPL11314) United States Department of Agriculture 2010-12-16 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
19,498,176
(2,166,464×9)
9 by_platform
by_series
4 DNA methylation profiles in the uterus during early pregnancy (GSE43501) [オリゴアレイ] Agilent-027994 DNZ/UoA_Bovine_~415k_v1 (GPL16270) DairyNZ Ltd 2013-01-15 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
18,409,952
(418,408×44)
44 by_platform
by_series
5 Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds (GSE19866) [オリゴアレイ] NimbleGen Bos taurus Btau31 WG CGH (GPL9865) United States Department of Agriculture 2010-01-12 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
17,327,160
(385,048×45)
45 by_platform
by_series
6 Analysis of copy number variations among diverse cattle breeds (GSE19866) [オリゴアレイ] NimbleGen Bos taurus Btau40 WG CGH (GPL9866) United States Department of Agriculture 2010-01-12 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
17,281,125
(384,025×45)
45 by_platform
by_series
7 Identification of Copy Number Variants in Dogs (GSE36333) [オリゴアレイ] Agilent-027178 Dog Whole Ensembl Gene Array 2-2-2010 024881 (GPL15316) Texas A&M University 2012-03-07 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
13,028,928
(420,288×31)
1 30 by_platform
by_series
8 Copy number variation of individual cattle genomes using next-generation sequencing. (GSE31018) [オリゴアレイ] NimbleGen Bos taurus UMD3.0 2.1M WG HD CGH (GPL11314) United States Department of Agriculture 2011-07-28 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
10,832,320
(2,166,464×5)
5 by_platform
by_series
9 Genomic and epigenomic analysis of taurine and indicine cattle (GSE41624) [オリゴアレイ] Agilent-025320 Bovine Whole Genome Array 400K 9-8-09 (GPL16182) Texas A&M University 2012-10-16 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
10,086,912
(420,288×24)
24 by_platform
by_series
10 A Snapshot of Copy Number Variation in the pig genome (GSE10753) [オリゴアレイ] Nimblegen 385K pig array CGH (GPL6553) Aarhus University, Faculty of Agricultural Sciences 2008-03-06 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
9,426,672
(392,778×24)
24 by_platform
by_series
11 Genome-wide CNVs within and between breeds (GSE26170) [オリゴアレイ] NimbleGen Dog 137K 12plex CGH array (090529_CanFam_TN_CGH) (GPL11333) University of Washington 2010-12-18 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
8,763,456
(136,929×64)
64 by_platform
by_series
12 Identification of global copy number variations among diverse pig breeds by a CGH array (GSE41488) [オリゴアレイ] NimbleGen pig CGH array (GPL16165) Huazhong Agricultural University 2012-10-10 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
8,632,032
(719,336×12)
12 by_platform
by_series
13 Identification of copy number variants in horses (GSE32702) [オリゴアレイ] Agilent-027318 Horse_Whole_Genome_equCab2_Exon_Array V1 (GPL14675) Texas A&M University 2011-10-07 ウマ(Equus caballus)
Equus caballus
7,565,184
(420,288×18)
18 by_platform
by_series
14 Canine CNVs associated with canFam2 segmental duplications (GSE13266) [オリゴアレイ] Custom Nimblegen aCGH chip targeted to canFam2 segmental duplications. (GPL7501) University of Washington 2008-10-17 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
7,342,132
(386,428×19)
19 by_platform
by_series
15 De novo copy number variations in cloned dogs (Nimblegen) (GSE49092) [オリゴアレイ] IRCGP Canine 720K v1.0 (GPL17479) Catholic University of Korea 2013-07-22 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
6,474,510
(719,390×9)
9 by_platform
by_series
16 De novo copy number variations in cloned dogs (GSE49357) [オリゴアレイ] IRCGP Canine 720K v1.0 (GPL17479) Catholic University of Korea 2013-07-30 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
6,474,510
(719,390×9)
9 by_platform
by_series
17 Gene expression in Longissimus lumborum in pig using the GenmascqChip (custom 15K Agilent microarray) (GSE28714) [オリゴアレイ] [Agilent-019442] Agilent/INRA FH Sus scrofa 15K muscle array [Probe Name version] (GPL11445) INRA 2011-04-19 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
4,942,600
(15,208×325)
325 by_platform
by_series
18 Transcriptional profiling of six normal Angus tissues (GSE23837) [オリゴアレイ] BOMC Bovine 25K v1.0 (GPL8813) University of Minnesota 2010-08-26 ウシ(Bos taurus)
Bos taurus
4,320,000
(30,000×144)
48 24 24 48 by_platform
by_series
19 FS001: Aberrant gene expression in dogs with portosystemic shunts (GSE39005) [オリゴアレイ] A-UMCU-C44K-1.0 (GPL15184) UMC Utrecht, Netherlands 2012-06-28 Canis lupus familiaris
Canis lupus familiaris
4,160,240
(45,220×92)
92 by_platform
by_series
20 The peripheral blood transcriptome reflects variations in immunity traits in swine: toward identification of biomarkers (GSE45196) [オリゴアレイ] SLA/Immune Response/NRSP8 Pig 70 mers Oligonucleotides 3.8K + 13.3K v1 (GPL7151) INRA 2013-03-15 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
4,128,000
(19,200×215)
82 133 by_platform
by_series
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