遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-06-15English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(521,594)
  霊長
(5,069)
  齧歯
(189,292)
  哺乳
(16,929)
  脊椎
(18,759)
  無脊椎
(38,793)
  植物
(93,301)
  バクテリア
(39,613)
  ウィルス
(1,263)
  ファージ
(101)
  未分類
(5,497)
  すべて
(931,947)
 
  SAGE NlaIII
(88)
  SAGE RsaI
(0)
  SAGE Sau3A
(0)
  MPSS
(298)
  GeneChip
(27,654)
  タイリングアレイ
(5,201)
  cDNAアレイ
(24,041)
  オリゴアレイ
(30,982)
  ビーズアレイ
(0)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(0)
  RT-PCR
(0)
  HT-Seq
(4,835)
  その他
(117)
  すべて
(93,301)
 
 
(0)
 
(0)
  結合
(0)
  生殖
(0)
 
(0)
  消化
(0)
 
(0)
 
(0)
 
(0)
  分泌
(0)
  胎児
(0)
  地上構造
(49)
  若い地上構造
(85)
 
(32)
  成長点
(26)
  花・生殖
(9)
  種子・果実
(3)
  混合
(3)
  分類不能
(91)
  すべて
(298)
 
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サンプルID タイトル データ数 登録機関 登録日 プラットフォーム サンプルタイプ 生物種 臓器分類 分類の根拠
黒字の強調部分が臓器分類時に用いたキーワードになります。
1 GSM170917 FLR library 118,998 University of Delaware 2007-02-22 [MPSS] Rice small RNA MPSS signatures (GPL3776) MPSS イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
花・生殖 Nipponbare Immature panicles- 90 days old plants
2 GSM302812 xue_rice_seed_MPSS 111,161 Institute of Plant Physiology and Ecology,Shanghai Institutes for Biological Sciences 2008-07-02 [MPSS] IPPE Rice MPSS (GPL7013) MPSS イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
種子・果実 rice seed small RNA
3 GSM65747 Inflorescence tissues, small RNA MPSS 67,528 University of Delaware 2005-07-26 [MPSS] Small RNA identification in Arabidopsis thaliana using modified MPSS (GPL2675) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
花・生殖 Inflorescence tissue
4 GSM226844 MPSS-AP1-17bp 58,833 University of Manchester 2007-09-04 [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
成長点 ap1-10 infloresence - mixed stage, immature buds, signature MPSS
5 GSM170921 STM library 57,101 University of Delaware 2007-02-22 [MPSS] Rice small RNA MPSS signatures (GPL3776) MPSS イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
Stem
6 GSM265799 UNT library 52,928 University of Delaware 2008-02-13 [MPSS] Rice small RNA MPSS signatures (GPL3776) MPSS イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
若い地上構造物 Seedling control for ABA treatment
7 GSM226767 MPSS-INS-17bp 51,933 University of Manchester 2007-09-04 [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
成長点 Infloresence - mixed stage, immature buds, signature MPSS
8 GSM226845 MPSS-AP3-17bp 50,412 University of Manchester 2007-09-04 [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
成長点 ap3-6 infloresence - mixed stage, immature buds, signature MPSS
9 GSM170901 NL4 library 48,664 University of Delaware 2007-02-22 [MPSS] Rice mRNA MPSS signatures (GPL3777) MPSS イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
Mature Leaf - Combination of Replicates
10 GSM361970 Col-0 red light over Col-0 dark replicate 1 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 Rc-grown Col-0 seedlings DD-grown Col-0 seedlings
11 GSM361971 Col-0 red light over Col-0 dark replicate 2 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 Rc-grown Col-0 seedlings DD-grown Col-0 seedlings
12 GSM361972 Col-0 red light over Col-0 dark replicate 3 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 Rc-grown Col-0 seedlings DD-grown Col-0 seedlings
13 GSM361973 pifQ dark over Col-0 dark replicate 1 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 DD-grown pifQ seedlings DD-grown Col-0 seedlings
14 GSM361974 pifQ dark over Col-0 dark replicate 2 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 DD-grown pifQ seedlings DD-grown Col-0 seedlings
15 GSM361975 pifQ dark over Col-0 dark replicate 3 45,220 KAIST 2009-01-21 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
若い地上構造物 DD-grown pifQ seedlings DD-grown Col-0 seedlings
16 GSM646169 Ler vs hy5 1 45,220 CIB-CSIC 2010-12-27 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
分類不能 source_name:hy5-1 Ler title:Ler vs hy5 1 description:Biological replicate 1 of 3. 3-week-old Arabidopsis plants exposed 1 day at 4ºC.
17 GSM646170 Ler vs hy5 2 45,220 CIB-CSIC 2010-12-27 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
分類不能 source_name:hy5-1 Ler title:Ler vs hy5 2 description:Biological replicate 2 of 3. 3-week-old Arabidopsis plants exposed 1 day at 4ºC.
18 GSM646171 Ler vs hy5 3 45,220 CIB-CSIC 2010-12-27 [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) RNA シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
分類不能 source_name:hy5-1 Ler title:Ler vs hy5 3 description:Biological replicate 3 of 3. 3-week-old Arabidopsis plants exposed 1 day at 4ºC.
19 GSM226768 MPSS-LES-17bp 42,569 University of Manchester 2007-09-04 [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
Leaves - 21 day, untreated, signature MPSS
20 GSM226769 MPSS-ROS-17bp 42,253 University of Manchester 2007-09-04 [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) MPSS シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
Root - 21 day, untreated
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