遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2014-04-12English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(22,139)
  霊長
(288)
  齧歯
(15,364)
  哺乳
(970)
  脊椎
(1,364)
  無脊椎
(4,819)
  植物
(7,611)
  バクテリア
(3,409)
  ウィルス
(59)
  ファージ
(8)
  未分類
(433)
  すべて
(56,529)
 
  SAGE NlaIII
(76)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(10)
  MPSS
(5)
  GeneChip
(7,316)
  タイリングアレイ
(312)
  cDNAアレイ
(732)
  オリゴアレイ
(3,361)
  ビーズアレイ
(1,268)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(5)
  RT-PCR
(117)
  HT-Seq
(2,116)
  その他
(45)
  すべて
(15,364)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Zscan4 transiently reactivates early embryonic genes during the generation of induced pluripotent stem cells Part B (GSE31423) [オリゴアレイ] NIA Mouse 44K Microarray v3.0 (Whole Genome 60-mer Oligo) [Agilent 015087] (GPL6867) NIH 2011-08-16 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
840,680
(42,034×20)
20 by_platform
by_series
2 Zscan4 transiently reactivates early embryonic genes during the generation of induced pluripotent stem cells Part A (GSE28436) [オリゴアレイ] NIA Mouse 44K Microarray v3.0 (Whole Genome 60-mer Oligo) [Agilent 015087] (GPL6867) NIH 2011-04-06 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
1,513,224
(42,034×36)
2 34 by_platform
by_series
3 Zscan4 transiently reactivates early embryonic genes during the generation of induced pluripotent stem cells (GSE31435) [オリゴアレイ] NIA Mouse 44K Microarray v3.0 (Whole Genome 60-mer Oligo) [Agilent 015087] (GPL6867) NIH 2011-08-17 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
2,353,904
(42,034×56)
2 54 by_platform
by_series
4 Zrf1 is required to establish and maintain neural progenitor identity (mRNA array) (GSE53541) [オリゴアレイ] Agilent-028005 SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Microarray (Feature Number version) (GPL13912) Centre for Genomic Regulation 2013-12-20 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
503,808
(62,976×8)
8 by_platform
by_series
5 Zrf1 is required to establish and maintain neural progenitor identity (GSE53542) [オリゴアレイ] Agilent-028005 SurePrint G3 Mouse GE 8x60K Microarray (Feature Number version) (GPL13912) Centre for Genomic Regulation 2013-12-20 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
503,808
(62,976×8)
8 by_platform
by_series
6 Zic3 ChIP-on-chip in mouse ES cells (GSE22195) [オリゴアレイ] Agilent-014716 Mouse Promoter ChIP-on-Chip Set 244K, Microarray 1 of 2 (G4490A) (Feature Number version) (GPL4128) Genome Institute of Singapore 2010-06-08 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
243,504
(243,504×1)
1 by_platform
by_series
7 Zic3 ChIP-on-chip in mouse ES cells (GSE22195) [オリゴアレイ] Agilent-014717 Mouse Promoter ChIP-on-Chip Set 244K, Microarray 2 of 2 (G4490A) (Feature Number version) (GPL4129) Genome Institute of Singapore 2010-06-08 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
243,504
(243,504×1)
1 by_platform
by_series
8 ZHBTc4 ES cells stably expressing EGFP vs Nr5a2-EGFP or Oct4-EGFP vs Nr5a2-EGFP (GSE52034) [オリゴアレイ] Agilent-026655 Whole Mouse Genome Microarray 4x44K v2 (Probe Name version) (GPL11202) Sogang 2013-11-04 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
78,972
(39,486×2)
2 by_platform
by_series
9 Zfp90 Transgenic Signature in Mouse White Adipose Tissue (GSE7029) [オリゴアレイ] Rosetta/Merck (C57BL/6J X C3H/HeJ)F2 on ApoE null backgrounds 75K oligio array 1 (GPL2510) Merck 2007-02-14 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
188,592
(23,574×8)
8 by_platform
by_series
10 ZBTB32 Is an Early Repressor of the CIITA MHC Class II Gene Expression during B Cell Differentiation to Plasma Cells (GSE17999) [オリゴアレイ] ABI Mouse Genome Survey Microarray (GPL2995) Emory University 2009-09-08 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
132,048
(33,012×4)
4 by_platform
by_series
11 ZAS3-null vs wild-type whole mouse thymus (GSE6570) [オリゴアレイ] Agilent-011978 Mouse Microarray G4121A (Feature Number version) (GPL891) Texas Children's Cancer Center/Baylor College of Medicine 2006-12-19 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
112,875
(22,575×5)
5 by_platform
by_series
12 Yuan- microRNAs upregulated in Ep300-overexpressing mouse heart (GSE50843) [オリゴアレイ] ORB version 1 MicroRNA Microarray (Sanger version 9.0 microRNA database) (GPL17724) Nanette Bishopric 2013-09-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
4,564
(1,141×4)
4 by_platform
by_series
13 YG001: A Usp7-Tip60 pathway regulates early adipogenesis (GSE28587) [オリゴアレイ] A-UMCU-M44K-1.0 (GPL13383) UMC Utrecht, Netherlands 2011-04-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
542,640
(45,220×12)
12 by_platform
by_series
14 Yap1/Birc, c-Met and N-ras DNA amplifications are mutually exclusive in mouse mammary tumors. (GSE28432) [オリゴアレイ] NimbleGen Mouse 385kb array [2006-07-26_MM8_WG_CGH] (GPL11620) Netherlands Cancer Institute 2011-04-06 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
25,800,293
(385,079×67)
67 by_platform
by_series
15 Xenopus M-phase extract treated induced pluripotent stem cells (GSE31691) [オリゴアレイ] NimbleGen IGH Mus musculus array [100718_MM9_EXP] (GPL14353) INSTITUTE of HUMAN GENETICS 2011-08-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
132,510
(44,170×3)
1 2 by_platform
by_series
16 wuHMM: a robust algorithm to detect DNA copy number variation using long oligonucleotide microarray data (GSE10511) [オリゴアレイ] NimbleGen Mouse 2.1M NCBI36 (GPL6436) Children's Hospital, Boston 2008-02-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
4,299,774
(2,149,887×2)
2 by_platform
by_series
17 wuHMM: a robust algorithm to detect DNA copy number variation using long oligonucleotide microarray data (GSE10511) [オリゴアレイ] NimbleGen Mouse 3.1M NCBI36 (GPL6363) Children's Hospital, Boston 2008-02-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
3,076,954
(3,076,954×1)
1 by_platform
by_series
18 wuHMM: a robust algorithm to detect DNA copy number variation using long oligonucleotide microarray data (GSE10511) [オリゴアレイ] NimbleGen Mouse 388K NCBI34 (GPL4276) Children's Hospital, Boston 2008-02-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
388,352
(388,352×1)
1 by_platform
by_series
19 WT vs Hypomethylated Forebrain Gene Expression (GSE14216) [オリゴアレイ] Agilent-014868 Whole Mouse Genome Microarray 4x44K G4122F (Probe Name version) (GPL7202) UCLA 2008-12-24 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
41,278
(41,278×1)
1 by_platform
by_series
20 WT vs Hypomethylated DRG Gene Expression (GSE23530) [オリゴアレイ] Agilent-014868 Whole Mouse Genome Microarray 4x44K G4122F (Probe Name version) (GPL7202) NAIST 2010-08-10 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
41,278
(41,278×1)
1 by_platform
by_series
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