遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2014-04-12English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(22,139)
  霊長
(288)
  齧歯
(15,364)
  哺乳
(970)
  脊椎
(1,364)
  無脊椎
(4,819)
  植物
(7,611)
  バクテリア
(3,409)
  ウィルス
(59)
  ファージ
(8)
  未分類
(433)
  すべて
(56,529)
 
  SAGE NlaIII
(76)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(10)
  MPSS
(5)
  GeneChip
(7,316)
  タイリングアレイ
(312)
  cDNAアレイ
(732)
  オリゴアレイ
(3,361)
  ビーズアレイ
(1,268)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(5)
  RT-PCR
(117)
  HT-Seq
(2,116)
  その他
(45)
  すべて
(15,364)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Quantitative sequencing of 5-formylcytosine in DNA at single-base resolution (GSE56572) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) CRUK Cambridge Institute 2014-04-07 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
12
(0×12)
12 by_platform
by_series
2 ER and RNA PolII ChIP-seq in WT and ER mutant mouse uterus (GSE56501) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) NIEHS 2014-04-03 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
5
(0×5)
5 by_platform
by_series
3 The histone methyltransferase activity of MLL1 is dispensable for hematopoiesis and leukemogenesis (GSE56456) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) Geisel School of Medicine at Dartmouth 2014-04-02 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
11
(0×11)
11 by_platform
by_series
4 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes (GSE56395) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
18
(0×18)
18 by_platform
by_series
5 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes [ChIP-Seq] (GSE56393) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
17
(0×17)
17 by_platform
by_series
6 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes (GSE56395) [HT-Seq] AB SOLiD 4 System (Mus musculus) (GPL14602) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
3
(0×3)
3 by_platform
by_series
7 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes [ChIP-Seq] (GSE56393) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
1
(0×1)
1 by_platform
by_series
8 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes [ChIP-Seq] (GSE56393) [HT-Seq] AB SOLiD 4 System (Mus musculus) (GPL14602) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
1
(0×1)
1 by_platform
by_series
9 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes (GSE56395) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) University of Birmingham 2014-04-01 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
1
(0×1)
1 by_platform
by_series
10 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes [Mnase-Seq] (GSE56360) [HT-Seq] AB SOLiD 4 System (Mus musculus) (GPL14602) University of Birmingham 2014-03-31 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
2
(0×2)
2 by_platform
by_series
11 Transcriptional landscape of Rag2 -/- thymocytes [ShortRNA-Seq] (GSE56358) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) University of Birmingham 2014-03-31 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
1
(0×1)
1 by_platform
by_series
12 Expression profiling by high throughput sequencing (GSE56292) [HT-Seq] Illumina HiSeq 1500 (Mus musculus) (GPL18480) RIKEN 2014-03-27 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
15
(0×15)
9 6 by_platform
by_series
13 Transient expression of Bcl6 is sufficient for oncogenic function and induction of mature B-cell lymphoma (GSE56310) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) Stanford University 2014-03-27 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
4
(0×4)
2 2 by_platform
by_series
14 Gene expression in Kras-driven lung tumors in mice fed with standard or high calorie diet (GSE56260) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Geneva 2014-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
498,091
(45,281×11)
11 by_platform
by_series
15 High-fat diet-mediated dysbiosis promotes intestinal carcinogenesis independent of obesity (GSE56257) [GeneChip] [MoGene-1_0-st] Affymetrix Mouse Gene 1.0 ST Array [CDF: mogene10st_Mm_ENTREZG_17.1.0] (GPL17777) Universitaetsmedizin Goettingen 2014-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
381,366
(21,187×18)
18 by_platform
by_series
16 A Smooth Muscle-Like Origin for Beige Adipocytes (GSE56248) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) Dana-Farber Cancer Institute 2014-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
8
(0×8)
8 by_platform
by_series
17 Expression data from liver of young and old rats fed on different dietary fat sources, namely virgin olive, sunflower or fish oils (GSE56166) [GeneChip] [Rat230_2] Affymetrix Rat Genome 230 2.0 Array (GPL1355) CIBM 2014-03-25 ドブネズミ(Rattus norvegicus)
Rattus norvegicus
559,782
(31,099×18)
18 by_platform
by_series
18 Regulation of the mouse heart transcriptome by Celf1 (GSE56185) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Mus musculus) (GPL9250) MIT 2014-03-25 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
15
(0×15)
15 by_platform
by_series
19 Identification of mechano- and/or 5Aza-sensitive genes in mouse carotid artery endothelium in vivo exposed to disturbed blood flow for 7 days (GSE56143) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) Georgia Tech & Emory University 2014-03-24 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
20 Expression profiling of EpH4 mouse mammary epithelial cells overexpressing the AP-1 transcription factor component Fra1 (GSE56089) [cDNAアレイ] IMP Genomics Mouse 53MM (GPL18447) CNIO 2014-03-21 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
69,378
(23,126×3)
3 by_platform
by_series
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