遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-04-06English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(17,885)
  霊長
(199)
  齧歯
(12,016)
  哺乳
(754)
  脊椎
(1,115)
  無脊椎
(3,796)
  植物
(6,479)
  バクテリア
(2,920)
  ウィルス
(51)
  ファージ
(4)
  未分類
(249)
  すべて
(45,516)
 
  SAGE NlaIII
(76)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(10)
  MPSS
(5)
  GeneChip
(6,053)
  タイリングアレイ
(284)
  cDNAアレイ
(717)
  オリゴアレイ
(2,718)
  ビーズアレイ
(888)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(3)
  RT-PCR
(82)
  HT-Seq
(1,149)
  その他
(30)
  すべて
(12,016)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Gene expression profiles in liver of F344 rat treated with chemical (GSE45650) [オリゴアレイ] Agilent-015749 Rat ToxArrayIII ver.2 44Kx4 array (GPL16936) Chemicals Evaluation and Research Institute, Japan 2013-03-30 ドブネズミ(Rattus norvegicus)
Rattus norvegicus
527,040
(21,960×24)
24 by_platform
by_series
2 Closely related parasites trigger distinct innate immune signaling pathways_I (GSE45632) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Pennsylvania 2013-03-29 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
3 Closely related parasites trigger distinct innate immune signaling pathways (GSE45634) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Pennsylvania 2013-03-29 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
4 Prdm14 (GSE45509) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Cambridge 2013-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
5 Genome-wide identification of genes differentially expressed between wild-type and Prdm14-deficient ES cells grown in 2i culture conditions. (GSE45507) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Cambridge 2013-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
271,686
(45,281×6)
6 by_platform
by_series
6 Genome-wide identification of genes differentially expressed between control and Prdm14 overexpressing ES cells grown in serum conditions. (GSE45508) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Cambridge 2013-03-26 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
271,686
(45,281×6)
6 by_platform
by_series
7 SFMBT1 Functions with LSD1 to Regulate Expression of Canonical Histone Genes and Chromatin-Related Factors (GSE45489) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) HHMI/NYU 2013-03-25 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
8
(0×8)
4 4 by_platform
by_series
8 SFMBT1 Functions with LSD1 to Regulate Expression of Canonical Histone Genes and Chromatin-Related Factors [ChIP-Seq] (GSE45441) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) HHMI/NYU 2013-03-22 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
8
(0×8)
4 4 by_platform
by_series
9 Cell-autonomous function of Runx1 transcriptionally regulates megakaryocytic maturation in mice (ChIP-seq) (GSE45372) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer IIx (Mus musculus) (GPL11002) Weizmann Institute of Science 2013-03-21 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
3
(0×3)
1 2 by_platform
by_series
10 Cell-autonomous function of Runx1 transcriptionally regulates megakaryocytic maturation in mice (GSE45374) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer IIx (Mus musculus) (GPL11002) Weizmann Institute of Science 2013-03-21 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
3
(0×3)
1 2 by_platform
by_series
11 Laser Capture Microdissection-Reduced Representation Bisulfite Sequencing (LCM-RRBS) maps changes in DNA methylation associated with gonadectomy-induced adrenocortical neoplasia in the mouse (GSE45361) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) Washington University in St. Louis 2013-03-20 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
17
(0×17)
11 6 by_platform
by_series
12 Profiling of copy-number variation between DNA isolation from different tissues of BN and ACI rats (GSE45308) [オリゴアレイ] Hubrecht Rat 2.1M HX1 (GPL9991) Hubrecht Institute 2013-03-19 ドブネズミ(Rattus norvegicus)
Rattus norvegicus
51,410,304
(2,142,096×24)
24 by_platform
by_series
13 mRNA profiling of GGT-HIF2aM3 (gamma-HIF2alphaM3) kidney cortex (GSE45254) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) Weill Cornell Medical College 2013-03-18 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
12
(0×12)
12 by_platform
by_series
14 Gene expression alterations due to defective Fbw7-dependent cyclin E ubiquitination in bone marrow erythroid cells (GSE45135) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) Northwestern University 2013-03-13 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
15 Retinoic acid signaling is essential for HSC development (GSE45020) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) University of Toronto 2013-03-11 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
271,686
(45,281×6)
6 by_platform
by_series
16 Oprl1 regulation of amygdala-dependent fear in mice and humans with PTSD (GSE44944) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) Emory University 2013-03-07 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
543,372
(45,281×12)
12 by_platform
by_series
17 CG methylated microarrays identify novel methylated sequence bound by the CEBPB|ATF4 heterodimer that are active in vivo (GSE44942) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) NCI, NIH 2013-03-07 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
4
(0×4)
2 2 by_platform
by_series
18 Tet1 as a Negative Regulator of Somatic Cell Reprogramming (GSE44935) [HT-Seq] Illumina HiSeq 2000 (Mus musculus) (GPL13112) Guangzhou Institutes Of Biomedicine and Health Chinese Academy Of Science 2013-03-06 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
2
(0×2)
2 by_platform
by_series
19 Histamine H3 Receptor Integrates Peripheral Inflammatory Signals in the Neurogenic Control of Immune Responses and Autoimmune Disease Susceptibility (GSE44873) [GeneChip] [Mouse430A_2] Affymetrix Mouse Genome 430A 2.0 Array (GPL8321) University of Vermont 2013-03-05 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
181,520
(22,690×8)
8 by_platform
by_series
20 Gene-expression changes in cerium chloride-induced injury of mouse hippocampus (GSE44906) [ビーズアレイ] Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip (GPL6887) Medical College of Soochow University 2013-03-05 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
90,562
(45,281×2)
2 by_platform
by_series
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