遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-04-06English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(502,421)
  霊長
(4,928)
  齧歯
(181,106)
  哺乳
(16,260)
  脊椎
(18,263)
  無脊椎
(37,338)
  植物
(91,454)
  バクテリア
(39,082)
  ウィルス
(1,266)
  ファージ
(101)
  未分類
(5,242)
  すべて
(898,944)
 
  SAGE NlaIII
(13)
  SAGE RsaI
(0)
  SAGE Sau3A
(0)
  MPSS
(2)
  GeneChip
(2,708)
  タイリングアレイ
(76)
  cDNAアレイ
(6,040)
  オリゴアレイ
(8,729)
  ビーズアレイ
(0)
  タンパク質アレイ
(0)
  抗体アレイ
(0)
  RT-PCR
(46)
  HT-Seq
(626)
  その他
(5)
  すべて
(18,263)
 
 
(2,316)
 
(853)
  結合
(622)
  生殖
(1,377)
 
(1,168)
  消化
(523)
 
(2,287)
 
(795)
 
(375)
  分泌
(189)
  胎児
(2,115)
  地上構造
(0)
  若い地上構造
(0)
 
(0)
  成長点
(0)
  花・生殖
(0)
  種子・果実
(0)
  混合
(1,158)
  分類不能
(4,485)
  すべて
(18,263)
 
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サンプルID タイトル データ数 登録機関 登録日 プラットフォーム サンプルタイプ 生物種 臓器分類 分類の根拠
黒字の強調部分が臓器分類時に用いたキーワードになります。
1 GSM727519 TDRD1IPlong 9,924,201 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 RNA obtained from immunoprecipitation with Tdrd1 antibody from zebrafish testis extract
2 GSM727524 ZiliIPTes 7,748,487 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:RNA obtained from immunoprecipitation with Zili antibody title:ZiliIPTes description:Small RNA sequence data (RIP-Seq)
3 GSM475282 Xenopus-egg_Y12-associated small RNAs 3,886,632 Memorial Sloan Kettering Cancer Center 2009-11-24 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Xenopus (Silurana) tropicalis) (GPL9320) SRA アフリカツメガエル(Xenopus (Silurana) tropicalis)
Xenopus tropicalis
卵巣・子房 Xenopus-egg_Y12-associated small RNAs
4 GSM830244 hen1 mutant polyA 3,494,197 Hubrecht Institute 2011-11-09 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 testis
5 GSM830246 hen1 mutant ligation 3,041,843 Hubrecht Institute 2011-11-09 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 testis
6 GSM727520 TDRD1IPshort 2,761,702 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 RNA obtained from immunoprecipitation with Tdrd1 antibody from zebrafish testis extract
7 GSM830247 wildtype ligation 2,541,184 Hubrecht Institute 2011-11-09 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 testis
8 GSM861785 kdrl:egfp-pos microRNA 2,435,707 Umass Medical School 2012-01-12 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer (Danio rerio) (GPL10164) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:FACS-isolated kdrl:egfp-positive cells title:kdrl:egfp-pos microRNA description:GFPplus microRNA
9 GSM727522 WT3WK 1,935,663 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
卵巣・子房 3 week old whole gonads
10 GSM727523 WTTESTIS 1,762,922 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 adult testis extract
11 GSM744253 Gastrula_dorsal_explant 1,739,435 P. Universidad Catolica de Chile 2011-06-17 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer IIx (Xenopus (Silurana) tropicalis) (GPL13741) SRA アフリカツメガエル(Xenopus (Silurana) tropicalis)
Xenopus tropicalis
胎児・胚 Embryo, dorsal
12 GSM861784 miRNA_GFP_minus 1,589,089 Umass Medical School 2012-01-12 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer (Danio rerio) (GPL10164) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
胎児・胚 whole zebrafish embryos at 24 hpf
13 GSM861786 kdrl:egfp-min microRNA 1,497,971 Umass Medical School 2012-01-12 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer (Danio rerio) (GPL10164) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:FACS-isolated egfp-negative cells title:kdrl:egfp-min microRNA description:GFPminus microRNA
14 GSM727525 ZiwiIPTes 1,494,922 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 RNA obtained from immunoprecipitation with Ziwi antibody from zebrafish testis extract
15 GSM744254 Gastrula_ventral_explant 1,481,303 P. Universidad Catolica de Chile 2011-06-17 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer IIx (Xenopus (Silurana) tropicalis) (GPL13741) SRA アフリカツメガエル(Xenopus (Silurana) tropicalis)
Xenopus tropicalis
胎児・胚 Embryo, ventral
16 GSM727521 TDRD1WK3 1,268,813 Hubrecht Institute 2011-05-20 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
卵巣・子房 3 week old tdrd1 mutant gonads
17 GSM371824 D.rerio_adult_pooled infected fish_1,2,3 and 4 (s7) 1,156,021 University of Leiden 2009-02-17 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:pooled whole adult fish (M.marinum-infected) title:D.rerio_adult_pooled infected fish_1,2,3 and 4 (s7) description:s_7
18 GSM830245 wildtype polyA 1,048,827 Hubrecht Institute 2011-11-09 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
精巣 testis
19 GSM371822 D.rerio_adult_pooled infected fish_1,2,3 and 4 (s3) 879,888 University of Leiden 2009-02-17 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:pooled whole adult fish (M.marinum-infected) title:D.rerio_adult_pooled infected fish_1,2,3 and 4 (s3) description:s_3
20 GSM371821 D.rerio_adult_pooled control fish 1,2,3 and 4 (s2) 803,866 University of Leiden 2009-02-17 [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Danio rerio) (GPL9319) SRA ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Danio rerio
分類不能 source_name:pooled whole adult fish (healthy control) title:D.rerio_adult_pooled control fish 1,2,3 and 4 (s2) description:s_2
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