遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2014-04-12English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(22,139)
  霊長
(288)
  齧歯
(15,364)
  哺乳
(970)
  脊椎
(1,364)
  無脊椎
(4,819)
  植物
(7,611)
  バクテリア
(3,409)
  ウィルス
(59)
  ファージ
(8)
  未分類
(433)
  すべて
(56,529)
 
  SAGE NlaIII
(228)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(16)
  MPSS
(67)
  GeneChip
(19,582)
  タイリングアレイ
(4,015)
  cDNAアレイ
(5,993)
  オリゴアレイ
(14,254)
  ビーズアレイ
(4,043)
  タンパク質アレイ
(1)
  抗体アレイ
(43)
  RT-PCR
(338)
  HT-Seq
(7,682)
  その他
(247)
  すべて
(56,529)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Genome-wide survey of large rare copy number variations in Alzheimer’s disease among Caribbean Hispanics (GSE33528) [ビーズアレイ] Illumina HumanHap650Yv2 Genotyping BeadChip (HumanHap650Y_v2-0_GenotypingBC_11237679_A) (GPL14932) Tanz Centre for Neurodegenerative Diseases 2011-11-07 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
805,351,815
(662,841×1,215)
1,215 by_platform
by_series
2 Genomic landscape of copy number aberrations enables the identification of oncogenic drivers in hepatocellular carcinoma (GSE38326) [ビーズアレイ] Illumina HumanOmni1-Quad BeadChip (GPL8882) Pfizer 2012-05-30 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
686,532,238
(1,140,419×602)
316 286 by_platform
by_series
3 Genomic landscape of copy number aberrations enables the identification of oncogenic drivers in hepatocellular carcinoma [tumor] (GSE38323) [ビーズアレイ] Illumina HumanOmni1-Quad BeadChip (GPL8882) Pfizer 2012-05-30 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
652,319,668
(1,140,419×572)
286 286 by_platform
by_series
4 Genome-wide signatures of differential DNA methylation in pediatric acute lymphoblastic leukemia (GSE49031) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) Uppsala University 2013-07-18 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
458,870,265
(485,577×945)
879 6 38 22 by_platform
by_series
5 Genome-wide signatures of differential DNA methylation and gene expression in pediatric ALL (GSE49032) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) Uppsala University 2013-07-18 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
458,870,265
(485,577×945)
879 6 38 22 by_platform
by_series
6 EPIC-Italy at HuGeF (GSE51032) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) Imperial College London 2013-09-20 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
410,312,565
(485,577×845)
845 by_platform
by_series
7 Dynamic Changes in the Copy Number of Pluripotency and Cell Proliferation Genes in Human ES and iPS Cells during Reprogramming and Time in Culture (GSE25925) [ビーズアレイ] Illumina HumanOmni1-Quad BeadChip (GPL8882) THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE 2010-12-08 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
369,495,756
(1,140,419×324)
29 24 84 2 13 5 2 4 8 6 9 138 by_platform
by_series
8 A data-driven approach to preprocessing Illumina 450K methylation array data (GSE43414) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) King's College London 2013-01-10 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
337,961,592
(485,577×696)
601 95 by_platform
by_series
9 Differential DNA methylation in Rheumatoid arthritis (GSE42861) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) Johns Hopkins University School of Medicine 2012-12-12 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
334,562,553
(485,577×689)
1 1 687 by_platform
by_series
10 Genome-wide Methylation Profiles Reveal Quantitative Views of Human Aging Rates (GSE40279) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) Sage Bionetworks 2012-08-21 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
318,538,512
(485,577×656)
656 by_platform
by_series
11 Screening ethnically diverse human embryonic stem cells identifies a chromosome 20 minimal amplicon conferring growth advantage (GSE33522) [ビーズアレイ] Illumina HumanOmni1-Quad BeadChip (GPL8882) Genome Institute of Singapore 2011-11-07 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
299,930,197
(1,140,419×263)
1 262 by_platform
by_series
12 Hepatocellular Carcinoma Differential Network (SNP profiling of tumor and non-tumor tissue) (GSE28127) [ビーズアレイ] Illumina HumanHap650Yv3 Genotyping BeadChip (HumanHap650Yv3_A) (GPL6987) Merck 2011-03-23 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
265,028,118
(660,918×401)
401 by_platform
by_series
13 The Genome Wide Structure of the Jewish People (GSE21478) [ビーズアレイ] Illumina Human610-Quad v1.0 BeadChip (GPL8887) Estonian Biocentre 2010-04-22 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
236,563,281
(620,901×381)
381 by_platform
by_series
14 The effect of genotype and in utero environment on inter-individual variation in neonate DNA methylomes (GSE54445) [ビーズアレイ] Infinium HumanOmniExpressExome BeadChip (GPL18224) Singapore Institute for Clinical Sciences 2014-01-27 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
227,088,186
(958,178×237)
237 by_platform
by_series
15 The effect of genotype and in utero environment on inter-individual variation in neonate DNA methylomes (GSE54446) [ビーズアレイ] Infinium HumanOmniExpressExome BeadChip (GPL18224) Singapore Institute for Clinical Sciences 2014-01-27 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
227,088,186
(958,178×237)
237 by_platform
by_series
16 Genome-wide characterization of allelic chromatin in human fibroblast and lymphoblastoid cell lines by high-density allele-specific analyses (GSE51272) [ビーズアレイ] Illumina HumanOmni2.5-Quad BeadChip (GPL13314) McGill University 2013-09-30 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
220,500,000
(2,450,000×90)
90 by_platform
by_series
17 The CURELUNG Project from the Epigenetics Side (Patients dataset) (GSE39279) [ビーズアレイ] Illumina HumanMethylation450 BeadChip (HumanMethylation450_15017482) (GPL13534) IDIBELL 2012-07-11 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
215,596,188
(485,577×444)
444 by_platform
by_series
18 Genotyping in Neuroblastoma Primary tumors (GSE19385) [ビーズアレイ] Illumina HumanHap550 Genotyping BeadChip v1 (GPL6433) Childrens Hospital of Philadelphia 2009-12-08 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
211,033,760
(555,352×380)
380 by_platform
by_series
19 The relationship between DNA methylation, genetic and expression inter-individual variation in untransformed human fibroblasts [genotyping] (GSE52442) [ビーズアレイ] Illumina Human1M-Duov3 DNA Analysis BeadChip (Human1M-Duov3_B) (GPL6984) McGill University and Génome Québec Innovation Centre 2013-11-16 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
208,658,538
(1,199,187×174)
174 by_platform
by_series
20 The relationship between DNA methylation, genetic and expression inter-individual variation in untransformed human fibroblasts (GSE53261) [ビーズアレイ] Illumina Human1M-Duov3 DNA Analysis BeadChip (Human1M-Duov3_B) (GPL6984) McGill University 2013-12-12 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
208,658,538
(1,199,187×174)
174 by_platform
by_series
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