遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-06-15English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(18,625)
  霊長
(206)
  齧歯
(12,612)
  哺乳
(782)
  脊椎
(1,156)
  無脊椎
(4,045)
  植物
(6,642)
  バクテリア
(2,980)
  ウィルス
(50)
  ファージ
(4)
  未分類
(287)
  すべて
(47,440)
 
  SAGE NlaIII
(224)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(16)
  MPSS
(56)
  GeneChip
(17,192)
  タイリングアレイ
(3,579)
  cDNAアレイ
(5,850)
  オリゴアレイ
(12,094)
  ビーズアレイ
(3,016)
  タンパク質アレイ
(1)
  抗体アレイ
(39)
  RT-PCR
(246)
  HT-Seq
(4,931)
  その他
(183)
  すべて
(47,440)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Human 32 MPSS samples (GSE1747) [MPSS] Massively Parallel Signature Sequencing - MPSS (classic method) (GPL1443) Lynx Therapeutics, Inc. 2004-09-10 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
12,533,408
(391,669×32)
9 4 4 1 3 2 2 6 1 by_platform
by_series
2 MPSS mouse transcriptome analysis project (GSE1581) [MPSS] MPSS [DpnII: Mus musculus] signature list (GPL1010) Solexa 2004-07-21 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
6,242,424
(71,752×87)
22 6 10 6 6 7 3 2 3 7 3 12 by_platform
by_series
3 An expression atlas of rice mRNAs and small RNAs (GSE7107) [MPSS] Rice mRNA MPSS signatures (GPL3777) University of Delaware 2007-02-22 イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
4,499,820
(249,990×18)
6 1 5 1 3 1 1 by_platform
by_series
4 A Comparison of microarray and MPSS Technology Platforms for Expression Analysis of Arabidopsis (GSE8994) [MPSS] Arabidopsis mRNA MPSS signatures (GPL5800) University of Manchester 2007-09-10 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
3,270,443
(297,313×11)
3 1 6 1 by_platform
by_series
5 Arabidopsis thaliana tetraploid transcriptome (GSE18482) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) Technische Universität München, WZW 2009-10-08 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
2,170,560
(45,220×48)
12 36 by_platform
by_series
6 Profiling of caf1a and caf1b mutants (GSE17022) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) UCSD 2009-07-08 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
1,220,940
(45,220×27)
27 by_platform
by_series
7 Genome-wide analysis for rice small RNAs by MPSS (GSE10523) [MPSS] Rice small RNA MPSS signatures (GPL3776) University of Delaware 2008-02-14 イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
1,197,816
(299,454×4)
3 1 by_platform
by_series
8 The protective role of silicon in the Arabidopsis-powdery mildew pathosystem (GSE5718) [MPSS] Agilent-012600 Arabidopsis 3 Oligo Microarray (4142A (Feature Number version) (GPL2871) Laval University 2006-09-01 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
1,062,960
(44,290×24)
24 by_platform
by_series
9 Root transcriptome remodeling of Arabidopsis in response to high levels of magnesium sulfate (GSE20109) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) University of Florida 2010-01-29 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
904,400
(45,220×20)
20 by_platform
by_series
10 An expression atlas of rice mRNAs and small RNAs (GSE7107) [MPSS] Rice small RNA MPSS signatures (GPL3776) University of Delaware 2007-02-22 イネ(Oryza sativa)
Oryza sativa
898,362
(299,454×3)
1 1 1 by_platform
by_series
11 Small RNA identification in Arabidopsis thaliana using modified MPSS (GSE3008) [MPSS] Small RNA identification in Arabidopsis thaliana using modified MPSS (GPL2675) University of Delaware 2005-07-26 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
726,328
(181,582×4)
2 2 by_platform
by_series
12 Dynamics of membrane potential variation and gene expression induced by Spodoptera littoralis, Myzus persicae, and Pseudomonas syringae in Arabidopsis (GSE40926) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) University of Turin 2012-09-17 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
542,640
(45,220×12)
12 by_platform
by_series
13 Functional analysis of HSFB transcription factors [22°C] (GSE14702) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology 2009-02-04 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
452,200
(45,220×10)
4 6 by_platform
by_series
14 Functional analysis of Arabidopsis HSFB transcription factor (GSE31888) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology 2011-09-06 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
452,200
(45,220×10)
4 6 by_platform
by_series
15 Comparison of Arabidopsis callus (GSE21631) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Probe Name version) (GPL7299) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology 2010-05-03 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
450,636
(37,553×12)
3 9 by_platform
by_series
16 MPSS analysis of mouse BLK CL.4 and liver cells (GSE1067) [MPSS] MPSS [DpnII: Mus musculus] signature list (GPL1010) Solexa 2004-02-25 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
430,512
(71,752×6)
3 3 by_platform
by_series
17 Comparison of SND2-overexpressing and wild type Arabidopsis thaliana Col-0 inflorescence stems (GSE29693) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Feature Number version) (GPL6177) University of Pretoria 2011-06-02 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
361,760
(45,220×8)
8 by_platform
by_series
18 Functional characterization of Arabidopsis mutants deficient in cytosolic APX1 and peroxisomal CAT2 (GSE19857) [MPSS] Agilent-012600 Arabidopsis 3 Oligo Microarray (4142A (Feature Number version) (GPL2871) Flanders Institute for Biotechnology (VIB) 2010-01-12 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
354,320
(44,290×8)
8 by_platform
by_series
19 Gene expression profiles in Arabidopsis plants during the treatment of AgNO3. (GSE34606) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Probe Name version) (GPL7299) Osaka Prefecture University 2011-12-21 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
337,977
(37,553×9)
9 by_platform
by_series
20 Transcriptomic analysis of the voz1 voz2 double mutant (GSE24741) [MPSS] Agilent-015059 Arabidopsis 3 Oligo Microarray 4x44K G2519F (Probe Name version) (GPL7299) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology 2010-10-16 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
300,424
(37,553×8)
8 by_platform
by_series
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