遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2013-04-06English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(17,885)
  霊長
(199)
  齧歯
(12,016)
  哺乳
(754)
  脊椎
(1,115)
  無脊椎
(3,796)
  植物
(6,479)
  バクテリア
(2,920)
  ウィルス
(51)
  ファージ
(4)
  未分類
(249)
  すべて
(45,516)
 
  SAGE NlaIII
(224)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(16)
  MPSS
(56)
  GeneChip
(16,580)
  タイリングアレイ
(3,529)
  cDNAアレイ
(5,792)
  オリゴアレイ
(11,628)
  ビーズアレイ
(2,848)
  タンパク質アレイ
(1)
  抗体アレイ
(37)
  RT-PCR
(223)
  HT-Seq
(4,411)
  その他
(158)
  すべて
(45,516)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 Comparison of gene expression and mutant fitness in Zymomonas mobilis ZM4 (GSE39466) [オリゴアレイ] NimbleGen Custom Zymomonas mobilis ZM4 12-plex (GPL15822) Lawrence Berkeley Lab 2012-07-18 Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4
Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4
71,516
(1,882×38)
38 by_platform
by_series
2 Transcriptome Profiling of Zymomonas mobilis under furfural stress (GSE37848) [オリゴアレイ] NimbleGen_BIOMA_Zymomonas mobilis_array [DesignID 549081] (GPL15541) Biogas Institute of Ministry of Agriculture 2012-05-08 Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4
Zymomonas mobilis subsp. mobilis ZM4
11,610
(1,935×6)
6 by_platform
by_series
3 Expression analysis of a respiration-deficient mutant of Zymomonas mobilis (GSE22355) [オリゴアレイ] NimbleGen_Zymomonas mobilis ZM4_4x72K array (GPL10545) Beppu university 2010-06-15 Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191
Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191
15,984
(3,996×4)
4 by_platform
by_series
4 Genome changes associated with a Zymomonas mobilis sodium acetate-tolerant mutant (AcR) (GSE18106) [cDNAアレイ] Nimblegen/NCSU Zymomonas mobilis array (GPL9192) Science Apps, L3C 2009-09-14 Zymomonas mobilis
Zymomonas mobilis
117,000
(5,850×20)
20 by_platform
by_series
5 Zymomonas mobilis oxygen stress responses (GSE10302) [オリゴアレイ] ZMOBCombimatrixplatform (GPL6431) Science Apps, L3C 2008-01-28 Zymomonas mobilis
Zymomonas mobilis
53,304
(2,221×24)
24 by_platform
by_series
6 Comparative sequence analysis of plant small RNAs (GSE28755) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Zostera marina) (GPL14640) University of Delaware 2011-04-20 アマモ(Zostera marina)
Zostera marina
3
(0×3)
1 1 1 by_platform
by_series
7 High-throughput sequencing of small RNAs in Zostera marina (GSE32480) [HT-Seq] Illumina Genome Analyzer II (Zostera marina) (GPL14640) University of Delaware 2011-09-29 アマモ(Zostera marina)
Zostera marina
3
(0×3)
1 1 1 by_platform
by_series
8 Seasonal Changes in Patterns of Gene Expression in Avian Song Control Brain Regions (GSE28347) [cDNAアレイ] Songbird Neurogenomics Initiative 20K Array (GPL9554) University of Illinois 2011-04-03 Zonotrichia leucophrys gambelii,Taeniopygia guttata
Zonotrichia leucophrys gambelii,Taeniopygia guttata
1,431,360
(20,160×71)
71 by_platform
by_series
9 The impact of experience-dependent and independent factors on gene expression in songbird brain [e01] (GSE36705) [cDNAアレイ] Songbird Neurogenomics Initiative 20K Array (GPL9554) University of Illinois 2012-03-22 Zonotrichia leucophrys gambelii,Taeniopygia guttata
Zonotrichia leucophrys gambelii,Taeniopygia guttata
1,431,360
(20,160×71)
71 by_platform
by_series
10 Zoarces viviparus evaluation data (GSE14957) [オリゴアレイ] Zoarces viviparus validation microarray (GPL8222) University of Gothenburg 2009-02-23 Zoarces viviparus
Zoarces viviparus
124,992
(124,992×1)
1 by_platform
by_series
11 Plant virus detection microarray (GSE15837) [オリゴアレイ] Plant virus detection microarray (GPL8484) Chinese Academy of Inspection and Quarantine 2009-04-27 Zinnia violacea
Zinnia violacea
5,865
(345×17)
17 by_platform
by_series
12 Ginger and Turmeric microarray in different tissues at different developmental stages (GSE16982) [オリゴアレイ] Gang Lab (Agilent)_Z.Officinale/C.Longa_15K array (GPL8746) The University of Arizona 2009-07-07 ショウガ(Zingiber officinale)
Zingiber officinale
729,984
(15,208×48)
2 31 15 by_platform
by_series
13 Analysis of Gene Expression in Ginger Tissues at Different Developmental Stages (GSE16734) [オリゴアレイ] Gang Lab (Agilent)_Z.Officinale/C.Longa_15K array (GPL8746) The University of Arizona 2009-06-20 ショウガ(Zingiber officinale)
Zingiber officinale
364,992
(15,208×24)
1 14 9 by_platform
by_series
14 The effect of temperature on Natural Antisense Transcript (NAT) expression in Aspergillus flavus (GSE12594) [GeneChip] Payne Aspergillus flavus 13,548 v1.0 (GPL7216) NC State University 2008-08-27 Zea mays,Aspergillus flavus
Zea mays,Aspergillus flavus
81,288
(13,548×6)
6 by_platform
by_series
15 Floral transition in maize infected with Sporisorium reilianum disrupts compatibility with this biotrophic fungal pathogen (GSE41916) [オリゴアレイ] Maize oligonucleotide array 46K version (GPL6438) Huangzhong agricultural university 2012-10-30 Zea mays subsp. mays
Zea mays subsp. mays
184,512
(46,128×4)
4 by_platform
by_series
16 Expression data from low nitrate culture in root in maize (GSE31231) [GeneChip] [miRNA-1_0] Affymetrix miRNA Array (GPL8786) Chinese Academy of Agricultural Sciences 2011-08-05 Zea mays subsp. mays
Zea mays subsp. mays
70,335
(7,815×9)
9 by_platform
by_series
17 miRNA expression data from low nitrate cultures in maize (GSE31492) [GeneChip] [miRNA-1_0] Affymetrix miRNA Array (GPL8786) Chinese Academy of Agricultural Sciences 2011-08-18 Zea mays subsp. mays
Zea mays subsp. mays
70,335
(7,815×9)
9 by_platform
by_series
18 Genome-wide expression quantitative trait loci (eQTL) analysis in maize (GSE29964) [オリゴアレイ] Maize Pioneer Hi-Bred 105K mRNA Microarray (GPL10837) Pioneer Hi-Bred International 2011-06-14 トウモロコシ(Zea mays)
Zea mays
26,057,856
(105,072×248)
248 by_platform
by_series
19 Maize Comparative Genomic Hybridization (CGH) between B73, Mo17, M0022 (RIL), and M0023 (RIL) (GSE16938) [オリゴアレイ] NimbleGen Zea Mays 2.1M array (GPL8790) Iowa State University 2009-07-02 トウモロコシ(Zea mays)
Zea mays
19,116,261
(2,124,029×9)
9 by_platform
by_series
20 Genomic Distribution of Maize Facultative Heterochromatin Marked by Trimethylation of H3K27 (GSE39456) [オリゴアレイ] NimbleGen 3x1.4M Maize Methylation Array (GPL15621) University of Minnesota 2012-07-18 トウモロコシ(Zea mays)
Zea mays
16,811,856
(1,400,988×12)
2 2 8 by_platform
by_series
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