遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン:2014-04-12English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
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データ単位 : [ データセット / サンプル / プラットフォーム ] 単位の説明>> <<説明を隠す
データセット  : 研究・目的ごとにまとめられた発現データの集合 (発現データマトリクス)
サンプル  : 測定に附された生体試料
プラットフォーム : 発現定量のための測定プロトコル
各タブ内に表示される数値は、そのタブ分類に属するデータ数です。
  ヒト
(22,139)
  霊長
(288)
  齧歯
(15,364)
  哺乳
(970)
  脊椎
(1,364)
  無脊椎
(4,819)
  植物
(7,611)
  バクテリア
(3,409)
  ウィルス
(59)
  ファージ
(8)
  未分類
(433)
  すべて
(56,529)
 
  SAGE NlaIII
(228)
  SAGE RsaI
(1)
  SAGE Sau3A
(16)
  MPSS
(67)
  GeneChip
(19,582)
  タイリングアレイ
(4,015)
  cDNAアレイ
(5,993)
  オリゴアレイ
(14,254)
  ビーズアレイ
(4,043)
  タンパク質アレイ
(1)
  抗体アレイ
(43)
  RT-PCR
(338)
  HT-Seq
(7,682)
  その他
(247)
  すべて
(56,529)
 
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タイトル プラットフォーム 登録機関 登録日 生物種 データサイズ
(プローブ数×サンプル数)
測定サンプル NCBI
FTP
サイト
動物 植物  
結合 生殖 消化 分泌 胎児 地上構造 若い地上構造 成長点 花・生殖 種子・果実 混合 分類不能
1 A Transcriptomic Analysis of Land Use Impacts on the Oyster, Crassostrea virginica, in the South Atlantic Bight. (GSE14793) [cDNAアレイ] Hollings Marine Laboratory Crassostrea cDNA Array (GPL3994) Medical University South Carolina 2009-02-11 Crassostrea virginica
Crassostrea virginica
16,020,000
(30,000×534)
266 268 by_platform
by_series
2 DNA copy number profiles of NSCLC tumors (GSE31798) [cDNAアレイ] BCCRC whole genome tilling path array v2 (March 2006 build) (GPL14360) BC Cancer Research Centre 2011-08-31 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
14,594,976
(53,856×271)
271 by_platform
by_series
3 DNA copy number and gene expression profiles of resected non-small cell lung cancer tumors (GSE31800) [cDNAアレイ] BCCRC whole genome tilling path array v2 (March 2006 build) (GPL14360) BC Cancer Research Centre 2011-08-31 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
14,594,976
(53,856×271)
271 by_platform
by_series
4 rilkit-eqtl analysis (random pair design). Tools to optimize the use of RIL populations for natural diversity studies and QTL cloning (GSE28791) [cDNAアレイ] URGV Arabidopsis thaliana 34.6K CATMA_v5 (GPL9553) INRA 2011-04-21 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)
Arabidopsis thaliana
11,225,628
(34,647×324)
324 by_platform
by_series
5 The impact of experience-dependent and independent factors on gene expression in songbird brain (GSE36748) [cDNAアレイ] Songbird Neurogenomics Initiative 20K Array (GPL9554) University of Illinois 2012-03-23 Taeniopygia guttata,Sturnus vulgaris
Taeniopygia guttata,Sturnus vulgaris
9,838,080
(20,160×488)
488 by_platform
by_series
6 use of aCGH in a large series of prenatal samples (GSE26654) [cDNAアレイ] qChipPre BAC Version (GPL11395) qGenomics 2011-01-17 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
8,810,496
(9,216×956)
1 1 954 by_platform
by_series
7 An atlas of mRNA expression in pig adipose and muscle tissues (GSE30343) [cDNAアレイ] Agilent-020109 Porcine Gene Expression Microarray (44K) (Probe Name version) (GPL10162) Sichuan Agricultural University 2011-06-30 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
7,848,540
(43,603×180)
108 36 36 by_platform
by_series
8 Major Patterns of B Cell Gene Expression Changes in Response to Short-Term Stimulation with 33 Single Ligands (GSE2050) [cDNAアレイ] Caltech 16K cDNA Mouse Array (GPL260) California Institute of Technology 2004-12-08 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
6,867,206
(16,273×422)
422 by_platform
by_series
9 Regulation of Gene Expression and Parent-of-Origin Effects in Maize Hybrids (GSE16136) [cDNAアレイ] SAM1.1a (GPL3333) Iowa State University 2009-05-15 トウモロコシ(Zea mays)
Zea mays
6,624,000
(19,200×345)
345 by_platform
by_series
10 Subclassification of lung adenocarcinoma (GSE20853) [cDNAアレイ] CHUGAI 41K (GPL962) Kyoto University 2010-03-12 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
6,620,352
(40,368×164)
164 by_platform
by_series
11 Gene expression profiles in liver of pigs with extreme high and low levels of androstenone. (GSE11073) [cDNAアレイ] DJF Pig 55K v1 (GPL6173) Aarhus University, Faculty of Agricultural Sciences 2008-04-05 ブタ、イノシシ(Sus scrofa)
Sus scrofa domestica
6,436,608
(55,488×116)
116 by_platform
by_series
12 Renal Cell Carcinoma Differential Expression (GSE3) [cDNAアレイ] Human Unigene I, part 1 (GPL9) German Cancer Research Center 2001-07-19 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
6,303,744
(36,864×171)
5 162 4 by_platform
by_series
13 Renal Cell Carcinoma Differential Expression (GSE3) [cDNAアレイ] Human Unigene I, part 2 (GPL10) German Cancer Research Center 2001-07-19 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
6,303,744
(36,864×171)
5 162 4 by_platform
by_series
14 Analysis of the Saccharomyces cerevisiae Pan-Genome Reveals a Pool of Copy Number Variants Distributed in Diverse Yeast Strains From Differing Industrial Environments. (GSE26689) [cDNAアレイ] Agilent 024417 Saccharomyces bayanus and Saccharomyces cerevisiae (SMD Print_1667) (GPL11575) Stanford University 2011-01-18 出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)
Saccharomyces cerevisiae
6,171,648
(62,976×98)
98 by_platform
by_series
15 Gene expression programs in PBMCs elicited by 6 major mediators of the immune response. (GSE17762) [cDNAアレイ] SMD Print_1163 Homo sapiens (GPL8601) University of London Tooting 2009-08-21 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
5,856,384
(38,784×151)
76 75 by_platform
by_series
16 Response of quiescent human fibroblasts to different growth factors and serum (GSE3901) [cDNAアレイ] Iyer Lab Human 46K cDNA microarray (GPL3279) University of Texas at Austin 2005-12-23 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
5,576,040
(46,467×120)
60 60 by_platform
by_series
17 Monkeypox and Vaccinia infection of cultured human cells (GSE11234) [cDNAアレイ] Print_1046 (GPL6762) Whitehead Institute for Biomedical Research 2008-04-22 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
5,285,376
(42,624×124)
85 39 by_platform
by_series
18 Stunned silence: gene expression programs in human cells infected with Monkeypox or Vaccinia virus (GSE24125) [cDNAアレイ] SMD Print_1046 LC-48 Homo sapiens (GPL10912) Stanford university school of medicine 2010-09-14 ヒト(Homo sapiens)
Homo sapiens
5,285,376
(42,624×124)
84 39 1 by_platform
by_series
19 NIA/NIH AGEMAP Multiple Tissues (GSE9909) [cDNAアレイ] NIA Mouse 17K_A (GPL738) National Institute on Aging, NIH 2007-12-14 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
5,271,552
(8,448×624)
239 116 39 78 32 40 40 40 by_platform
by_series
20 NIA/NIH AGEMAP Multiple Tissues (GSE9909) [cDNAアレイ] NIA Mouse 17K_B (GPL782) National Institute on Aging, NIH 2007-12-14 ハツカネズミ(Mus musculus)
Mus musculus
5,271,552
(8,448×624)
239 116 39 78 32 40 40 40 by_platform
by_series
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