遺伝子発現バンク(GEO)目次バージョン：2013-06-15English page
NCBI Gene Expression Omnibus (GEO) に登録されているデータを、測定技術と材料の属性に基づいて整理しました。
■ データセット数
ヒト 霊長 齧歯 哺乳 脊椎 無脊椎 植物 バクテリア ウィルス ファージ 未分類 すべて
SAGE NlaIII 77 1 76 13 7 19 31 224
SAGE RsaI 1 1
SAGE Sau3A 5 10 1 16
MPSS 2 5 1 1 47 56
GeneChip 7,376 101 6,310 282 237 503 1,728 641 14 17,192
タイリングアレイ 1,347 290 10 14 1,119 707 82 1 9 3,579
cDNAアレイ 1,905 10 724 148 257 471 1,590 677 1 4 61 5,848
オリゴアレイ 4,313 38 2,856 242 506 838 1,695 1,439 27 113 12,067
ビーズアレイ 2,063 12 929 5 3 4 3,016
タンパク質アレイ 1 1
抗体アレイ 35 4 39
RT-PCR 139 1 92 5 2 2 5 246
HT-Seq 1,280 41 1,285 73 129 1,084 818 125 21 62 4,918
その他 82 2 30 2 1 5 18 11 23 174
すべて 18,624 206 12,612 782 1,154 4,045 6,634 2,980 50 4 286 47,377

■ サンプル数
  脳
(65,657)		   血
(177,040)		   結合
(52,031)		   生殖
(39,694)		   筋
(25,023)		   消化
(32,693)		   肝
(52,978)		   肺
(32,616)		   腎
(19,280)		   分泌
(57,776)		   胎児
(19,180)		   地上構造
(12,240)		   若い地上構造
(8,419)		   根
(4,868)		   成長点
(2,307)		   花・生殖
(3,159)		   種子・果実
(3,165)		   混合
(53,094)		   分類不能
(270,727)		   すべて
(931,947)		  
ヒト 霊長 齧歯 哺乳 脊椎 無脊椎 植物 バクテリア ウィルス ファージ 未分類 すべて
SAGE NlaIII 756 5 718 37 13 66 88 1,683
SAGE RsaI 3 3
SAGE Sau3A 15 37 2 54
MPSS 35 100 2 4 298 439
GeneChip 243,618 2,656 94,264 5,399 2,745 7,125 27,654 7,463 532 391,456
タイリングアレイ 9,515 2,050 224 76 4,385 5,201 684 40 47 22,222
cDNAアレイ 39,559 154 11,257 3,563 6,153 7,705 24,041 10,536 102 101 1,208 104,379
オリゴアレイ 107,373 879 54,809 6,252 8,968 13,650 30,982 19,945 1,054 2,269 246,181
ビーズアレイ 94,915 909 14,658 559 406 576 112,023
タンパク質アレイ 5 5
抗体アレイ 1,134 26 1,160
RT-PCR 3,343 12 985 43 46 6 51 4,486
HT-Seq 14,724 286 9,960 838 733 5,437 4,835 877 67 771 38,528
その他 6,606 168 425 7 5 9 117 57 82 7,476
すべて 521,593 5,069 189,292 16,929 18,741 38,793 93,216 39,613 1,263 101 5,485 930,095

■ プラットフォーム数
ヒト 霊長 齧歯 哺乳 脊椎 無脊椎 植物 バクテリア ウィルス ファージ 未分類 すべて
SAGE NlaIII 5 1 6 3 9 21 37 1 83
SAGE RsaI 1 1
SAGE Sau3A 1 2 1 1 5
MPSS 2 4 1 1 9 17
GeneChip 323 4 139 15 10 28 82 91 12 704
タイリングアレイ 706 142 9 10 119 229 51 1 4 1,271
cDNAアレイ 1,052 3 403 77 79 214 566 284 8 5 35 2,726
オリゴアレイ 1,352 13 869 117 227 382 812 1,084 40 1 229 5,126
ビーズアレイ 121 58 3 2 2 186
タンパク質アレイ 1 1
抗体アレイ 21 3 24
RT-PCR 89 54 2 2 1 3 4 155
HT-Seq 51 17 85 82 71 257 473 165 27 2 102 1,332
その他 36 1 13 3 1 6 26 12 2 40 140
すべて 3,760 39 1,779 312 410 1,031 2,235 1,690 78 8 429 11,771
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